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Plant Communications | 基因组所李伟团队等联合解析太子参环肽关键环化酶
巴马瑶族自治县,作为中国长寿文化的重要发祥地,长久以来以“中药瑰宝·瑶医壮药”著称。其传统医药体系融合了瑶族、壮族的千年智慧,以“药食同源”为基本理念,孕育出独特的“长寿保健”特色。这一特色深深植根于当地丰富的药用植物资源与深厚的医药文化底蕴之中。 近日,巴马瑶族自治县乡村振兴研究院、中国农业科学院深圳农业基因组研究所李伟研究员领衔团队,在国际植物学顶级期刊《植物通讯(Plant Communications,影响因子10.5)》发表题为“Identification of a key pept…
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Nature | 黄三文团队系统揭示无性繁殖植物的基因组特征,提出马铃薯理想单倍型育种策略
马铃薯是典型的无性繁殖作物,基因组高度杂合,存在大量有害变异,只有系统揭示马铃薯的基因组特征,才能有效实现“无性繁殖作物有性化育种”。前期已经开展的马铃薯泛基因组(Nature, 2022)尚未完整解析杂合二倍体的两套单倍型。因此,构建能够完整解析单倍型的图泛基因组,以全面捕捉杂合信息和单倍型多样性,对马铃薯有性杂交育种具有重要意义。 北京时间1月23日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)黄三文团队在国际顶级学术期刊《自然(Nature)》上发表了…
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一颗马铃薯种子的乡村振兴力量
12月9日,巴马院成功引入了来自中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称基因组所)的杂交马铃薯育种技术成果——二倍体马铃薯(“优薯1号”与“优薯1.1号”)品种,并在巴马赐福田园综合体的冬闲田区域进行了种植。种植过程中,采用了高品质的栽培技术,并融合了地膜覆盖、节水灌溉、水肥一体化、粪污资源化利用等多项技术措施,通过科技手段的综合集成,推动马铃薯新品种的种植示范工作。 巴马院结合种植业与养殖业的实际需求,充分利用基因组所的成果与技术支持,在巴马实施“春夏种稻、冬闲种薯、薯块稻糠喂猪、猪粪肥田…
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巴马乡村振兴研究院获批实验动物生产许可证
近日,经广西壮族自治区科学技术厅审核批准,巴马乡村振兴研究院获批普通级小型猪实验动物生产许可证书。巴马院基地成为目前全国建设面积最大的实验动物巴马小型猪生产许可基地,这标志着巴马香猪的研究和产业化迈向新的阶段,将有效促进巴马香猪重大科技创新成果的转化,催生巴马香猪产业新质生产力。 巴马香猪是广西巴马的地理标志产品,在当地有不可替代的生产价值。由于巴马香猪在解剖结构、生理代谢以及疾病发生机理上与人类有很多相似之处,作为动物模型可以广泛应用于器械研发、药物评价、疾病治疗等方面。然而,随着巴马香猪研究…
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《自然—生物医学工程》:左二伟团队利用蛋白结构预测和相似性聚类开发高效、无序列偏好性的胞嘧啶碱基编辑器
北京时间2024年6月3日17时,中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队在Nature Biomedical Engineering发表了题为“Structure-guided discovery of highly efficient cytidine deaminases with sequence-context independence”的研究论文。 该研究创新性地运用AlphaFold2介导的蛋白结构预测和结构相似性聚类方法来挖掘新型胞嘧啶脱氨酶,并开发了高效、无序列偏好性的胞嘧…
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巴马:科技赋能助推乡村振兴
中国农业科学院深圳农业基因组研究所是一所专注于通过科技、人才及产业创新赋能农业高质量发展的科研单位。在粤桂协作机制推动下,基因组所多次前往对口帮扶地区—巴马调研,并于2019年在巴马成立广西巴马香猪资源开发工程研究中心,为推动巴马香猪产业化发展提供科技支持。2022年与巴马人民政府共同建设新型研发机构—巴马瑶族自治县乡村振兴研究院,旨在聚集中国农科院科研人才和成果资源,致力于挖掘开发利用巴马特色农业资源,用科技创新助力乡村振兴。 一、科技赋能亮点突出 科技创新既是农业发展的“生命线…
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JAFC | 广西大学/农业基因组所等联合转录/代谢分析揭示巴马火麻种子发育与脂肪酸积累机制
中国广西巴马县以长寿著称,而广西特色植物巴马火麻的种子含有丰富的亚油酸和α-亚麻酸等不饱和脂肪酸,对人体健康至关重要。然而,巴马火麻种子发育和油脂积累的机制尚未完全阐明。 广西大学农学院陈鹏教授团队联合中国农业科学院农业基因组研究所胡冠菁课题组,基于转录组学和代谢组学综合分析揭示了巴马火麻种发育和油脂积累的机制。研究成果以题为Integrated Transcriptomic and Metabolomic Analysis Reveal the Dynamic Process of Bama …
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Cell Discovery | 基因组所左二伟团队等联合开发碱基编辑工具效果预测新模型BE_Endo
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)左二伟课题组联合中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心孙怡迪课题组、临港实验室/中国科学院上海营养与健康研究所魏武课题组在《细胞发现(Cell Discovery)》上发表了题为“Deep learning models incorporating endogenous factors beyond DNA sequences improve the prediction accuracy of base e…
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新突破!基因组所左二伟团队研发出高效家禽基因敲入技术
近日,基因组所左二伟团队联合广西大学陆阳清团队在《生物工程杂志(Journal of Biological Engineering)》上在线发表了题为“An ovalbumin fusion strategy to increase recombinant protein secretion in chicken eggs”的研究论文。该研究研发出高效家禽基因敲入技术,成功实现在鸡的蛋清中生产非分泌型外源蛋白,这是利用家禽进行外源可分泌蛋白生产的一次成功尝试。 哺乳动物可以通过体细胞核移植技术或…
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“优薯计划”迎来新利器!基因组所黄三文团队开发进化透镜加速杂交马铃薯育种
北京时间2023年5月4日晚23时,国际权威期刊《细胞(Cell)》在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文团队的最新研究成果:“Phylogenomic discovery of deleterious mutations facilitates hybrid potato breeding(利用进化基因组学鉴定有害突变、加速杂交马铃薯育种)”。黄三文团队联合国内外多家单位,收集了大量茄科物种资源,通过对100个茄科基因组的比较分析来追踪最长8千万年、累计十二亿年的进化痕迹,在此基础…